При условии отдельно приобретенного фильтра к мешку без фильтра, необходимо сделать следующее. 

1 вариант. Приклеили фильтр к мешку, иглой сверху проткнули насквозь фильтр и одну стенку мешка к которой приклеили фильтр. Затем сверху на фильтр приклеили непроницаемый кусочек пластыря, либо иную наклейку на фильтры, которыми комплектуются калоприемники с фильтрами. Это такие наклейки с одной стороны липкие.

Если Вы используете фильтры от компании Колопласт, то они как раз комплектуются круглыми наклейками на фильтры, которые наклеиваются на фильтры после их сквозного прокалывания. Т.е. на самом фильтре сначала аккуратно отклеить нужно его верхний предохранительный липкий кружочек, проткнуть иглой фильтр, затем этот же липкий кружочек аккуратно сверху наклеить на данный фильтр обратно.

2 вариант. Приклеили фильтр к мешку, иглой изнутри очень аккуратно проткнули мешочек, но так, чтобы игла изнутри не прошла насквозь верхний слой фильтра (т.е. не на всю его толщину). Можно несколько сделать уколов иглой не посередине фильтра изнутри в сам его слой. Но это ювелирная работа.

Конечно, как Вы сделали отверстие насквозь через фильтр и мешок, не закрыв отверстие сверху, то, как Вы и описываете, естественно, газ будет просто выходить наружу беспрепятственно.